Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Lamb3Q61087 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Lamb3Q61087 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Lamb3Q61087 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Lamb3Q61087 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Lamb3Q61087 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,96■■■■□ 3,19
Lamb3Q61087 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Lamb3Q61087 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Lamb3Q61087 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Lamb3Q61087 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Lamb3Q61087 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Lamb3Q61087 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Lamb3Q61087 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Lamb3Q61087 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Lamb3Q61087 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Lamb3Q61087 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Lamb3Q61087 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Lamb3Q61087 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,23■■■□□ 2,91
Lamb3Q61087 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Lamb3Q61087 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Lamb3Q61087 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Lamb3Q61087 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
Lamb3Q61087 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
Lamb3Q61087 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Lamb3Q61087 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Lamb3Q61087 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Lamb3Q61087 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Lamb3Q61087 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Lamb3Q61087 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Lamb3Q61087 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Lamb3Q61087 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Lamb3Q61087 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Lamb3Q61087 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,29■■■□□ 2,76
Lamb3Q61087 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Lamb3Q61087 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Lamb3Q61087 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Lamb3Q61087 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Lamb3Q61087 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,95■■■□□ 2,7
Lamb3Q61087 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Lamb3Q61087 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Lamb3Q61087 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31,86■■■□□ 2,69
Lamb3Q61087 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Lamb3Q61087 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,77■■■□□ 2,68
Lamb3Q61087 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Lamb3Q61087 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Lamb3Q61087 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Lamb3Q61087 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Lamb3Q61087 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Lamb3Q61087 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Lamb3Q61087 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Lamb3Q61087 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Lamb3Q61087 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Lamb3Q61087 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Lamb3Q61087 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Lamb3Q61087 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Lamb3Q61087 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Lamb3Q61087 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Lamb3Q61087 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Lamb3Q61087 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Lamb3Q61087 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Lamb3Q61087 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Lamb3Q61087 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Lamb3Q61087 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Lamb3Q61087 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Lamb3Q61087 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Lamb3Q61087 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Lamb3Q61087 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Lamb3Q61087 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Lamb3Q61087 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamb3Q61087 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Lamb3Q61087 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Lamb3Q61087 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Lamb3Q61087 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Lamb3Q61087 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Lamb3Q61087 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lamb3Q61087 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Lamb3Q61087 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Lamb3Q61087 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Lamb3Q61087 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Lamb3Q61087 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Lamb3Q61087 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Lamb3Q61087 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Lamb3Q61087 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Lamb3Q61087 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Lamb3Q61087 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Lamb3Q61087 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Lamb3Q61087 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Lamb3Q61087 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Lamb3Q61087 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Lamb3Q61087 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Lamb3Q61087 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Lamb3Q61087 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Lamb3Q61087 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Lamb3Q61087 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Lamb3Q61087 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,7 ms