Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
Samsn1P57725 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Samsn1P57725 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Samsn1P57725 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Samsn1P57725 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Samsn1P57725 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Samsn1P57725 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Samsn1P57725 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Samsn1P57725 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Samsn1P57725 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Samsn1P57725 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Samsn1P57725 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Samsn1P57725 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Samsn1P57725 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Samsn1P57725 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Samsn1P57725 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Samsn1P57725 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Samsn1P57725 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Samsn1P57725 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Samsn1P57725 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Samsn1P57725 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Samsn1P57725 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Samsn1P57725 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Samsn1P57725 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Samsn1P57725 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Samsn1P57725 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Samsn1P57725 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Samsn1P57725 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Samsn1P57725 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Samsn1P57725 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Samsn1P57725 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Samsn1P57725 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Samsn1P57725 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Samsn1P57725 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Samsn1P57725 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Samsn1P57725 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Samsn1P57725 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Samsn1P57725 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Samsn1P57725 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Samsn1P57725 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Samsn1P57725 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Samsn1P57725 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Samsn1P57725 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Samsn1P57725 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Samsn1P57725 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Samsn1P57725 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Samsn1P57725 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Samsn1P57725 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Samsn1P57725 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Samsn1P57725 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Samsn1P57725 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Samsn1P57725 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Samsn1P57725 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Samsn1P57725 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Samsn1P57725 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Samsn1P57725 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Samsn1P57725 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Samsn1P57725 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Samsn1P57725 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Samsn1P57725 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Samsn1P57725 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Samsn1P57725 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Samsn1P57725 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Samsn1P57725 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Samsn1P57725 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Samsn1P57725 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samsn1P57725 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Samsn1P57725 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Samsn1P57725 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Samsn1P57725 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Samsn1P57725 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Samsn1P57725 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Samsn1P57725 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Samsn1P57725 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Samsn1P57725 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Samsn1P57725 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Samsn1P57725 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Samsn1P57725 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Samsn1P57725 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Samsn1P57725 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Samsn1P57725 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Samsn1P57725 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Samsn1P57725 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Samsn1P57725 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Samsn1P57725 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Samsn1P57725 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Samsn1P57725 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Samsn1P57725 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Samsn1P57725 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Samsn1P57725 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Samsn1P57725 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Samsn1P57725 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Samsn1P57725 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Samsn1P57725 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Samsn1P57725 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Samsn1P57725 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Samsn1P57725 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Samsn1P57725 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Samsn1P57725 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Samsn1P57725 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms