Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Samsn1P57725 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Samsn1P57725 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Samsn1P57725 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
Samsn1P57725 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Samsn1P57725 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Samsn1P57725 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Samsn1P57725 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Samsn1P57725 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,5■■■■□ 3,27
Samsn1P57725 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Samsn1P57725 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Samsn1P57725 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Samsn1P57725 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,98■■■■□ 3,19
Samsn1P57725 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,7■■■■□ 3,15
Samsn1P57725 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Samsn1P57725 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Samsn1P57725 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Samsn1P57725 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,28■■■■□ 3,08
Samsn1P57725 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34■■■■□ 3,03
Samsn1P57725 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Samsn1P57725 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Samsn1P57725 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Samsn1P57725 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Samsn1P57725 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Samsn1P57725 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Samsn1P57725 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Samsn1P57725 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Samsn1P57725 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,72■■■□□ 2,99
Samsn1P57725 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Samsn1P57725 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Samsn1P57725 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Samsn1P57725 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Samsn1P57725 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Samsn1P57725 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Samsn1P57725 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Samsn1P57725 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,28■■■□□ 2,92
Samsn1P57725 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Samsn1P57725 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,12■■■□□ 2,89
Samsn1P57725 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Samsn1P57725 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33,02■■■□□ 2,88
Samsn1P57725 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Samsn1P57725 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Samsn1P57725 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Samsn1P57725 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Samsn1P57725 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Samsn1P57725 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Samsn1P57725 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Samsn1P57725 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Samsn1P57725 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Samsn1P57725 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Samsn1P57725 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
Samsn1P57725 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,24■■■□□ 2,75
Samsn1P57725 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Samsn1P57725 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,1■■■□□ 2,73
Samsn1P57725 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Samsn1P57725 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Samsn1P57725 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Samsn1P57725 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2,71
Samsn1P57725 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Samsn1P57725 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Samsn1P57725 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,93■■■□□ 2,7
Samsn1P57725 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Samsn1P57725 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Samsn1P57725 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Samsn1P57725 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Samsn1P57725 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Samsn1P57725 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,82■■■□□ 2,68
Samsn1P57725 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Samsn1P57725 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Samsn1P57725 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31,72■■■□□ 2,67
Samsn1P57725 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Samsn1P57725 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Samsn1P57725 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Samsn1P57725 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Samsn1P57725 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Samsn1P57725 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,58■■■□□ 2,65
Samsn1P57725 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Samsn1P57725 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Samsn1P57725 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Samsn1P57725 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31,5■■■□□ 2,63
Samsn1P57725 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Samsn1P57725 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Samsn1P57725 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,39■■■□□ 2,62
Samsn1P57725 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Samsn1P57725 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Samsn1P57725 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Samsn1P57725 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Samsn1P57725 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Samsn1P57725 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Samsn1P57725 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Samsn1P57725 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31,04■■■□□ 2,56
Samsn1P57725 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Samsn1P57725 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Samsn1P57725 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Samsn1P57725 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,99■■■□□ 2,55
Samsn1P57725 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Samsn1P57725 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Samsn1P57725 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Samsn1P57725 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Samsn1P57725 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,81■■■□□ 2,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms