Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59.7■■■■■ 7.15
Neurl4Q5NCX5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55.81■■■■■ 6.52
Neurl4Q5NCX5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.6■■■■■ 6.33
Neurl4Q5NCX5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52.38■■■■■ 5.98
Neurl4Q5NCX5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51.15■■■■■ 5.78
Neurl4Q5NCX5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
Neurl4Q5NCX5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
Neurl4Q5NCX5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50.28■■■■■ 5.64
Neurl4Q5NCX5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50■■■■■ 5.6
Neurl4Q5NCX5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
Neurl4Q5NCX5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49.64■■■■■ 5.54
Neurl4Q5NCX5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49.14■■■■■ 5.46
Neurl4Q5NCX5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.77■■■■■ 5.4
Neurl4Q5NCX5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
Neurl4Q5NCX5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.68■■■■■ 5.38
Neurl4Q5NCX5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48.58■■■■■ 5.37
Neurl4Q5NCX5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Neurl4Q5NCX5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Neurl4Q5NCX5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Neurl4Q5NCX5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
Neurl4Q5NCX5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47.49■■■■■ 5.19
Neurl4Q5NCX5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
Neurl4Q5NCX5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Neurl4Q5NCX5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47.22■■■■■ 5.15
Neurl4Q5NCX5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Neurl4Q5NCX5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Neurl4Q5NCX5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Neurl4Q5NCX5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46.48■■■■■ 5.03
Neurl4Q5NCX5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Neurl4Q5NCX5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Neurl4Q5NCX5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Neurl4Q5NCX5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
Neurl4Q5NCX5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Neurl4Q5NCX5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Neurl4Q5NCX5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Neurl4Q5NCX5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Neurl4Q5NCX5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45.81■■■■■ 4.92
Neurl4Q5NCX5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.92
Neurl4Q5NCX5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
Neurl4Q5NCX5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
Neurl4Q5NCX5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
Neurl4Q5NCX5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
Neurl4Q5NCX5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Neurl4Q5NCX5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Neurl4Q5NCX5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
Neurl4Q5NCX5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Neurl4Q5NCX5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Neurl4Q5NCX5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
Neurl4Q5NCX5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Neurl4Q5NCX5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
Neurl4Q5NCX5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
Neurl4Q5NCX5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
Neurl4Q5NCX5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
Neurl4Q5NCX5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
Neurl4Q5NCX5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Neurl4Q5NCX5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
Neurl4Q5NCX5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.71
Neurl4Q5NCX5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Neurl4Q5NCX5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Neurl4Q5NCX5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Neurl4Q5NCX5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Neurl4Q5NCX5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Neurl4Q5NCX5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Neurl4Q5NCX5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Neurl4Q5NCX5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
Neurl4Q5NCX5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Neurl4Q5NCX5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Neurl4Q5NCX5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
Neurl4Q5NCX5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.55
Neurl4Q5NCX5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Neurl4Q5NCX5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Neurl4Q5NCX5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
Neurl4Q5NCX5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Neurl4Q5NCX5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
Neurl4Q5NCX5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
Neurl4Q5NCX5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
Neurl4Q5NCX5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
Neurl4Q5NCX5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
Neurl4Q5NCX5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
Neurl4Q5NCX5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Neurl4Q5NCX5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Neurl4Q5NCX5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Neurl4Q5NCX5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Neurl4Q5NCX5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Neurl4Q5NCX5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
Neurl4Q5NCX5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
Neurl4Q5NCX5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Neurl4Q5NCX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Neurl4Q5NCX5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Neurl4Q5NCX5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.67■■■■■ 4.42
Neurl4Q5NCX5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Neurl4Q5NCX5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
Neurl4Q5NCX5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Neurl4Q5NCX5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Neurl4Q5NCX5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms