Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCX5

Neurl4, Neuralized-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl4Q5NCX5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC59,7■■■■■ 7,15
Neurl4Q5NCX5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC55,81■■■■■ 6,52
Neurl4Q5NCX5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,6■■■■■ 6,33
Neurl4Q5NCX5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC52,38■■■■■ 5,98
Neurl4Q5NCX5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC51,15■■■■■ 5,78
Neurl4Q5NCX5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,51■■■■■ 5,68
Neurl4Q5NCX5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,33■■■■■ 5,65
Neurl4Q5NCX5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC50,28■■■■■ 5,64
Neurl4Q5NCX5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC50■■■■■ 5,6
Neurl4Q5NCX5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,89■■■■■ 5,58
Neurl4Q5NCX5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC49,64■■■■■ 5,54
Neurl4Q5NCX5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC49,14■■■■■ 5,46
Neurl4Q5NCX5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,77■■■■■ 5,4
Neurl4Q5NCX5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,7■■■■■ 5,39
Neurl4Q5NCX5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,68■■■■■ 5,38
Neurl4Q5NCX5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC48,58■■■■■ 5,37
Neurl4Q5NCX5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,55■■■■■ 5,36
Neurl4Q5NCX5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,02■■■■■ 5,28
Neurl4Q5NCX5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Neurl4Q5NCX5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Neurl4Q5NCX5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC47,49■■■■■ 5,19
Neurl4Q5NCX5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC47,46■■■■■ 5,19
Neurl4Q5NCX5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,44■■■■■ 5,18
Neurl4Q5NCX5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC47,22■■■■■ 5,15
Neurl4Q5NCX5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,19■■■■■ 5,14
Neurl4Q5NCX5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,56■■■■■ 5,04
Neurl4Q5NCX5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46,56■■■■■ 5,04
Neurl4Q5NCX5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC46,48■■■■■ 5,03
Neurl4Q5NCX5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC46,46■■■■■ 5,03
Neurl4Q5NCX5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,42■■■■■ 5,02
Neurl4Q5NCX5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,26■■■■■ 5
Neurl4Q5NCX5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,24■■■■■ 4,99
Neurl4Q5NCX5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,04■■■■■ 4,96
Neurl4Q5NCX5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,87■■■■■ 4,93
Neurl4Q5NCX5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC45,86■■■■■ 4,93
Neurl4Q5NCX5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,83■■■■■ 4,93
Neurl4Q5NCX5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC45,81■■■■■ 4,92
Neurl4Q5NCX5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC45,75■■■■■ 4,92
Neurl4Q5NCX5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,56■■■■■ 4,88
Neurl4Q5NCX5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC45,56■■■■■ 4,88
Neurl4Q5NCX5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC45,43■■■■■ 4,86
Neurl4Q5NCX5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45,37■■■■■ 4,85
Neurl4Q5NCX5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC45,32■■■■■ 4,85
Neurl4Q5NCX5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,19■■■■■ 4,82
Neurl4Q5NCX5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC45,19■■■■■ 4,82
Neurl4Q5NCX5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,09■■■■■ 4,81
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,01■■■■■ 4,8
Neurl4Q5NCX5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC45,01■■■■■ 4,8
Neurl4Q5NCX5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC44,94■■■■■ 4,78
Neurl4Q5NCX5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,87■■■■■ 4,77
Neurl4Q5NCX5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,85■■■■■ 4,77
Neurl4Q5NCX5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC44,8■■■■■ 4,76
Neurl4Q5NCX5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC44,71■■■■■ 4,75
Neurl4Q5NCX5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44,64■■■■■ 4,74
Neurl4Q5NCX5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,61■■■■■ 4,73
Neurl4Q5NCX5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC44,6■■■■■ 4,73
Neurl4Q5NCX5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC44,49■■■■■ 4,71
Neurl4Q5NCX5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC44,44■■■■■ 4,71
Neurl4Q5NCX5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,69
Neurl4Q5NCX5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
Neurl4Q5NCX5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC44,23■■■■■ 4,67
Neurl4Q5NCX5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC44,08■■■■■ 4,65
Neurl4Q5NCX5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44,08■■■■■ 4,65
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,97■■■■■ 4,63
Neurl4Q5NCX5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC43,96■■■■■ 4,63
Neurl4Q5NCX5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC43,84■■■■■ 4,61
Neurl4Q5NCX5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC43,71■■■■■ 4,59
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC43,67■■■■■ 4,58
Neurl4Q5NCX5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
Neurl4Q5NCX5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,66■■■■■ 4,58
Neurl4Q5NCX5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,57■■■■■ 4,57
Neurl4Q5NCX5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Neurl4Q5NCX5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC43,44■■■■■ 4,55
Neurl4Q5NCX5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,42■■■■■ 4,54
Neurl4Q5NCX5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43,4■■■■■ 4,54
Neurl4Q5NCX5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,38■■■■■ 4,54
Neurl4Q5NCX5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,37■■■■■ 4,53
Neurl4Q5NCX5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43,36■■■■■ 4,53
Neurl4Q5NCX5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,34■■■■■ 4,53
Neurl4Q5NCX5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC43,33■■■■■ 4,53
Neurl4Q5NCX5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC43,25■■■■■ 4,51
Neurl4Q5NCX5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,16■■■■■ 4,5
Neurl4Q5NCX5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,14■■■■■ 4,5
Neurl4Q5NCX5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,09■■■■■ 4,49
Neurl4Q5NCX5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Neurl4Q5NCX5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4,47
Neurl4Q5NCX5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,96■■■■■ 4,47
Neurl4Q5NCX5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,95■■■■■ 4,47
Neurl4Q5NCX5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Neurl4Q5NCX5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,86■■■■■ 4,45
Neurl4Q5NCX5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,44
Neurl4Q5NCX5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC42,73■■■■■ 4,43
Neurl4Q5NCX5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42,72■■■■■ 4,43
Neurl4Q5NCX5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42,7■■■■■ 4,43
Neurl4Q5NCX5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42,67■■■■■ 4,42
Neurl4Q5NCX5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Neurl4Q5NCX5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Neurl4Q5NCX5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Neurl4Q5NCX5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,59■■■■■ 4,41
Neurl4Q5NCX5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42,57■■■■■ 4,41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms