Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Stx1aO35526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Stx1aO35526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Stx1aO35526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Stx1aO35526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Stx1aO35526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Stx1aO35526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Stx1aO35526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Stx1aO35526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Stx1aO35526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Stx1aO35526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Stx1aO35526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Stx1aO35526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Stx1aO35526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Stx1aO35526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Stx1aO35526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Stx1aO35526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Stx1aO35526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Stx1aO35526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Stx1aO35526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Stx1aO35526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Stx1aO35526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Stx1aO35526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Stx1aO35526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Stx1aO35526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Stx1aO35526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Stx1aO35526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Stx1aO35526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Stx1aO35526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Stx1aO35526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Stx1aO35526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Stx1aO35526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Stx1aO35526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Stx1aO35526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Stx1aO35526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Stx1aO35526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Stx1aO35526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Stx1aO35526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Stx1aO35526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Stx1aO35526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Stx1aO35526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Stx1aO35526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Stx1aO35526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Stx1aO35526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Stx1aO35526 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Stx1aO35526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Stx1aO35526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Stx1aO35526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Stx1aO35526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Stx1aO35526 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Stx1aO35526 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Stx1aO35526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Stx1aO35526 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Stx1aO35526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Stx1aO35526 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Stx1aO35526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stx1aO35526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Stx1aO35526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Stx1aO35526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Stx1aO35526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Stx1aO35526 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Stx1aO35526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stx1aO35526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stx1aO35526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stx1aO35526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Stx1aO35526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Stx1aO35526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Stx1aO35526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Stx1aO35526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Stx1aO35526 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Stx1aO35526 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Stx1aO35526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Stx1aO35526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Stx1aO35526 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Stx1aO35526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Stx1aO35526 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Stx1aO35526 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Stx1aO35526 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Stx1aO35526 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Stx1aO35526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Stx1aO35526 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Stx1aO35526 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Stx1aO35526 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Stx1aO35526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Stx1aO35526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Stx1aO35526 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Stx1aO35526 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Stx1aO35526 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Stx1aO35526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Stx1aO35526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Stx1aO35526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Stx1aO35526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Stx1aO35526 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Stx1aO35526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Stx1aO35526 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Stx1aO35526 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Stx1aO35526 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms