Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,17■■■■□ 3,86
Stx1aO35526 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,96■■■■□ 3,83
Stx1aO35526 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Stx1aO35526 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Stx1aO35526 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Stx1aO35526 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Stx1aO35526 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Stx1aO35526 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Stx1aO35526 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Stx1aO35526 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Stx1aO35526 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Stx1aO35526 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Stx1aO35526 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Stx1aO35526 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Stx1aO35526 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Stx1aO35526 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Stx1aO35526 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Stx1aO35526 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,52■■■■□ 3,12
Stx1aO35526 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Stx1aO35526 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,44■■■■□ 3,1
Stx1aO35526 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,09
Stx1aO35526 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Stx1aO35526 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Stx1aO35526 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Stx1aO35526 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Stx1aO35526 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,8■■■■□ 3
Stx1aO35526 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Stx1aO35526 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Stx1aO35526 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Stx1aO35526 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Stx1aO35526 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Stx1aO35526 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Stx1aO35526 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,48■■■□□ 2,95
Stx1aO35526 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Stx1aO35526 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Stx1aO35526 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Stx1aO35526 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,2■■■□□ 2,9
Stx1aO35526 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Stx1aO35526 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Stx1aO35526 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,05■■■□□ 2,88
Stx1aO35526 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Stx1aO35526 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Stx1aO35526 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
Stx1aO35526 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Stx1aO35526 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Stx1aO35526 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Stx1aO35526 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Stx1aO35526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,65■■■□□ 2,82
Stx1aO35526 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Stx1aO35526 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Stx1aO35526 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Stx1aO35526 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Stx1aO35526 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Stx1aO35526 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Stx1aO35526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Stx1aO35526 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Stx1aO35526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Stx1aO35526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Stx1aO35526 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Stx1aO35526 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Stx1aO35526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Stx1aO35526 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Stx1aO35526 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,14■■■□□ 2,74
Stx1aO35526 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Stx1aO35526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Stx1aO35526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
Stx1aO35526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Stx1aO35526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Stx1aO35526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Stx1aO35526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Stx1aO35526 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Stx1aO35526 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Stx1aO35526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Stx1aO35526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Stx1aO35526 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Stx1aO35526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Stx1aO35526 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Stx1aO35526 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Stx1aO35526 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Stx1aO35526 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Stx1aO35526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Stx1aO35526 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Stx1aO35526 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
Stx1aO35526 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Stx1aO35526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Stx1aO35526 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Stx1aO35526 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Stx1aO35526 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Stx1aO35526 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Stx1aO35526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Stx1aO35526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Stx1aO35526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Stx1aO35526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Stx1aO35526 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Stx1aO35526 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Stx1aO35526 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Stx1aO35526 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Stx1aO35526 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,3 ms