RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dok7Q18PE0 504 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Aifm3Q3TY86 605 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Clca2Q8BG22 942 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ric3Q8BPM6 367 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gja10Q9WUS4 505 aa22.54■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NmiO35309 314 aa22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Akap2O54931 893 aa22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ripor2Q80U16 1078 aa22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 WaslQ91YD9 501 aa22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa22.53■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Megf6Q80V70 1572 aa22.52■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Trim34bJ3QNR8 485 aa22.52■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 BcanQ61361 883 aa22.52■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cyp2ab1S4R196 498 aa22.52■■□□□ 1.2
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zfp831A2ADM8 1628 aa22.51■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Psd3Q2PFD7 1037 aa22.51■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bend3Q6PAL0 825 aa22.51■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa22.51■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zap70P43404 618 aa22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 EappQ5BU09 281 aa22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Adgre1Q61549 931 aa22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ttc41Q692V3 1318 aa22.5■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zbtb38Q3LR78 1197 aa22.49■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Smc4Q8CG47 1286 aa22.49■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k13Q1HKZ5 959 aa22.48■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 UvssaQ9D479 717 aa22.48■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Flt1P35969 1333 aa22.48■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf609Q8BZ47 1413 aa22.48■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Q3UPC7 1272 aa22.47■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gjd4Q8BSD4 364 aa22.47■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nup188Q6ZQH8 1759 aa22.47■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Yy1Q00899 414 aa22.46■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NexnQ7TPW1 607 aa22.46■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dydc2Q9D3X8 139 aa22.46■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Grm8P47743 908 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Adarb2Q9JI20 745 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Myo3bQ1EG27 1305 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Greb1lB9EJV3 1913 aa22.45■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gnat3Q3V3I2 354 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ptf1aQ9QX98 324 aa22.44■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Col5a2Q3U962 1497 aa22.43■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Oas2E9Q9A9 742 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k9Q3U1V8 1077 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Kif2cQ922S8 721 aa22.42■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rps8P62242 208 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 CfhP06909 1234 aa22.4■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf330Q922H9 316 aa22.4■■□□□ 1.18
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 XpcP51612 930 aa22.39■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Naa16Q9DBB4 864 aa22.39■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Stk32bQ9JJX8 414 aa22.39■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Btaf1E9QAE3 1848 aa22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Itga6Q61739 1091 aa22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam122aQ9DB52 284 aa22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Vsig10D3YX43 558 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Csf1rP09581 977 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 VeztQ3ZK22 780 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pcsk7Q61139 770 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Insm1Q63ZV0 521 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mum1Q6DID5 682 aa22.37■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NpcdF8VQB8 469 aa22.36■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Map3k15A2AQW0 1331 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nutm1Q8BHP2 1126 aa22.35■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Atp6v1aP50516 617 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 GpkowQ56A08 488 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Vil1Q62468 827 aa22.34■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ube4aE9Q735 1028 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gpr101Q80T62 511 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Myoz2Q9JJW5 264 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Apbb1Q9QXJ1 710 aa22.33■■□□□ 1.17
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 NfixP70257 488 aa22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Znf428Q8C1M2 176 aa22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Plcd4Q8K3R3 807 aa22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Lgr5Q9Z1P4 907 aa22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ltn1Q6A009 1767 aa22.32■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 PnnO35691 725 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Chrna5Q2MKA5 467 aa22.31■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Best3Q6H1V1 669 aa22.31■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rwdd1Q9CQK7 243 aa22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.3 ms