RNA–Protein interactions for RNA: YOR258W

HNT3, Transcript of DNA 5' AMP hydrolase involved in DNA repair, yeast

Gene HNT3, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HNT3	YOR258W	YML122C	Q03207	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	PPG1	P32838	368 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	DOS2	P54858	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	PPM2	Q08282	695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.05	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	SRP101	P32916	621 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	YKL107W	P34251	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	UBA2	P52488	636 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	RKM4	Q12504	494 aa		5.04	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	CIT2	P08679	460 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	YKL151C	P36059	337 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	CCC2	P38995	1004 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	MDM38	Q08179	573 aa		5.03	□□□□□ -1.6
HNT3	YOR258W	DUT1	P33317	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	OAR1	P35731	278 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	MOH1	P38191	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	EEB1	Q02891	456 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	NSE3	Q05541	303 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	CDA1	Q06702	301 aa		5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SPE1	P08432	466 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	HSF1	P10961	833 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	CDC34	P14682	295 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	MNR2	P35724	969 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SRT1	Q03175	343 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SPO20	Q04359	397 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	NPC2	Q12408	173 aa		5.01	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	PRI2	P20457	528 aa		5	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	GDE1	Q02979	1223 aa		5	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SUL1	P38359	859 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	ALG12	P53730	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
HNT3	YOR258W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
HNT3	YOR258W	GIC1	P38785	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	YJL049W	P47048	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	NCS6	P53088	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	BDF2	Q07442	638 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	ENB1	Q08299	606 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	KAR4	P25583	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	FUN30	P31380	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	OSW7	P43611	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	HUL5	P53119	910 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	RPN4	Q03465	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HNT3	YOR258W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
HNT3	YOR258W	ATG19	P35193	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	BUD6	P41697	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	SFB2	P53953	876 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	RAD4	P14736	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	YMR206W	Q03695	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	ESC2	Q06340	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	YKL069W	P36088	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	OPI10	Q08202	246 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	MBP1	P39678	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	NPP2	P39997	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	TIM54	P47045	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	STB4	P50104	949 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	GUP2	Q08929	609 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	ERG4	P25340	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	KTR4	P38131	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	YGR053C	P53234	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	TSR4	P25040	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	SED4	P25365	1065 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	NUP82	P40368	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	MCH5	Q08777	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	UPC2	Q12151	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HNT3	YOR258W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TIM23	P32897	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	STU2	P46675	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	BUL1	P48524	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HNT3	YOR258W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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