RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CEP3P40969 608 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YFH7P43591 353 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W JJJ3P47138 172 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ASK10P48361 1146 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SWI1P09547 1314 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RSF1Q05043 376 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SNF2P22082 1703 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TGL4P36165 910 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TOF2Q02208 771 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W NUP1P20676 1076 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BIO2P32451 375 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KTR7P40504 517 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS25P47142 202 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MTC3P53077 123 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HDA1P53973 706 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PUP1P25043 261 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SWE1P32944 819 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAL12P53341 584 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YAT1P80235 687 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W PEX34P25584 144 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAL32P38158 584 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBP5P39944 805 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SUL2Q12325 893 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MOD5P07884 428 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SQT1P35184 431 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W APE1P14904 514 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HXT13P39924 564 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YEL020CP39994 560 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W INP52P50942 1183 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W DCD1P06773 312 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W PEP7P32609 515 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SOL2P37262 315 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PSY4P38193 441 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YHL050CP38721 697 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ERP5P38819 212 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YHR219WP38900 624 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ICP55P40051 511 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YNL115CP53925 644 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YML037CQ03703 340 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MCP2Q06567 569 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YEL077CQ3E7X8 1277 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KEX2P13134 814 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PSO2P30620 661 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MSS51P32335 436 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TFC3P34111 1160 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W STV1P37296 890 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBX7P38349 436 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS45P38932 577 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ECM23Q02710 187 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TAP42Q04372 366 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W COX17Q12287 69 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BCH2P36122 765 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W NNF2P53253 936 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TRS130Q03660 1102 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GLO2Q05584 274 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RKM4Q12504 494 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAM1P40065 302 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W IES1P43579 692 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YNL050CP53952 270 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PRC1P00729 532 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KAR1P11927 433 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS3P23643 1011 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HOG1P32485 435 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TY4A-JP47023 414 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PNS1Q12412 539 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MSB2P32334 1306 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CYT1P07143 309 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.5 ms