RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CEP3P40969 608 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YFH7P43591 353 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W JJJ3P47138 172 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ASK10P48361 1146 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W INP54Q08227 384 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SWI1P09547 1314 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data3.32□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RSF1Q05043 376 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SNF2P22082 1703 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TGL4P36165 910 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPT4P53549 437 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TOF2Q02208 771 aa3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W NUP1P20676 1076 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BIO2P32451 375 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KTR7P40504 517 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS25P47142 202 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MTC3P53077 123 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HDA1P53973 706 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PUP1P25043 261 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SWE1P32944 819 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAL12P53341 584 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YAT1P80235 687 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.31□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W PEX34P25584 144 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAL32P38158 584 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBP5P39944 805 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SUL2Q12325 893 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MOD5P07884 428 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SKG6P32900 734 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SQT1P35184 431 aa3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TY1B-DR3Q99231 1755 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W APE1P14904 514 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HXT13P39924 564 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YEL020CP39994 560 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W INP52P50942 1183 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W DCD1P06773 312 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data3.3□□□□□ -1.88not detected
SIN3YOL004W PEP7P32609 515 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SOL2P37262 315 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PSY4P38193 441 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YHL050CP38721 697 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ERP5P38819 212 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YHR219WP38900 624 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ICP55P40051 511 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YNL115CP53925 644 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YML037CQ03703 340 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MCP2Q06567 569 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YEL077CQ3E7X8 1277 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ENO1P00924 437 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KEX2P13134 814 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PSO2P30620 661 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MSS51P32335 436 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TFC3P34111 1160 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W STV1P37296 890 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W UBX7P38349 436 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS45P38932 577 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W ECM23Q02710 187 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TAP42Q04372 366 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W COX17Q12287 69 aa3.3□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W BCH2P36122 765 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W NNF2P53253 936 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TRS130Q03660 1102 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W GLO2Q05584 274 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RKM4Q12504 494 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W FUR4P05316 633 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MAM1P40065 302 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W IES1P43579 692 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W YNL050CP53952 270 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W Q0010Q9ZZX9 128 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PRC1P00729 532 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KAR1P11927 433 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W VPS3P23643 1011 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W HOG1P32485 435 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W TY4A-JP47023 414 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W PNS1Q12412 539 aa3.29□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W MSB2P32334 1306 aa3.28□□□□□ -1.88
SIN3YOL004W CYT1P07143 309 aa3.28□□□□□ -1.88
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