RNA–Protein interactions for RNA: YKL143W

LTV1, Transcript of Component of the GSE complex, yeast

Gene LTV1, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LTV1	YKL143W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	DUT1	P33317	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	VAC8	P39968	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	CWC24	P53769	259 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	EST2	Q06163	884 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	RAD27	P26793	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	ADD66	P36040	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	ATG14	P38270	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	RRT14	P40470	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	YGL082W	P53155	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	YNR063W	P53749	607 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	SIW14	P53965	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	ROD1	Q02805	837 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LTV1	YKL143W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ADP1	P25371	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	PFF1	P38244	976 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	HXT13	P39924	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	YGR045C	P53229	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	HXT17	P53631	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	HXT15	P54854	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	YAR028W	P39548	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	GIS1	Q03833	894 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TOP1	P04786	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	THI80	P35202	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	YGR053C	P53234	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	MDG1	P53885	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	YNL050C	P53952	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ERO1	Q03103	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RKM2	Q03942	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	BDF2	Q07442	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	PRD1	P25375	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	MKK2	P32491	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RER2	P35196	286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ENT3	P47160	408 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ZDS2	P54786	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	EEB1	Q02891	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	SSP2	Q08646	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	LAP2	Q10740	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	AFG2	P32794	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
LTV1	YKL143W	COQ4	O13525	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	PRI2	P20457	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	UBP16	Q02863	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	VPS64	Q03944	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	NSE3	Q05541	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	THI22	Q06490	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	IRC3	Q06683	689 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TYW3	P53177	273 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	ORC3	P54790	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	SSY1	Q03770	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	TRE1	Q08919	783 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	PTC5	Q12511	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	LYS2	P07702	1392 aa		4.9	□□□□□ -1.62
LTV1	YKL143W	HKR1	P41809	1802 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	BAS1	P22035	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	NFS1	P25374	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	LYP1	P32487	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YKU70	P32807	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	NNK1	P36003	928 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	FLR1	P38124	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	ALG3	P38179	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	SHC1	P39000	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	RTT109	Q07794	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	OPI10	Q08202	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LTV1	YKL143W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.2 ms