RNA–Protein interactions for RNA: YKL058W

TOA2, Transcript of TFIIA small subunit, yeast

Gene TOA2, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOA2	YKL058W	VPS60	Q03390	229 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	ERP3	Q12403	225 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	EUG1	P32474	517 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	YSC83	P32792	385 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	KTR2	P33550	425 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	EFM4	P40516	257 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	TOF1	P53840	1238 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TOA2	YKL058W	MTF2	P10849	440 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	PET123	P17558	318 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YEL1	P34225	687 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SMC3	P47037	1230 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	COS5	P47187	383 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	HVG1	P0CE11	249 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TVP38	P36164	337 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	BSD2	P38356	321 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SEC9	P40357	651 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TCB2	P48231	1178 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	BOP3	P53958	396 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SML1	Q04964	104 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	OPY2	Q06810	360 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YPR078C	Q06813	372 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	MCM16	Q12262	181 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YOL098C	Q12496	1037 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TUP1	P16649	713 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	HXT1	P32465	570 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	VPS35	P34110	944 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	REG2	P38232	338 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	LCB2	P40970	561 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	IES1	P43579	692 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	UBP15	P50101	1230 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	ROD1	Q02805	837 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	RBA50	Q04418	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	VAC14	Q06708	880 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DAS2	Q12084	232 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SFI1	Q12369	946 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	RAD57	P25301	460 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DPB3	P27344	201 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YEL043W	P32618	956 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	COT1	P32798	439 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TCD1	P38756	429 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	BUD16	P39988	312 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	MAL13	P53338	473 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DON1	Q05610	365 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YLR297W	Q05899	129 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SMC5	Q08204	1093 aa		10.17	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.16	□□□□□ -0.78	not detected
TOA2	YKL058W	SWI6	P09959	803 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SRB4	P32569	687 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TFC4	P33339	1025 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	IXR1	P33417	597 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	ATG19	P35193	415 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	NDC80	P40460	691 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	MDR1	P53258	950 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TY3A-G	Q12173	290 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TY3A-I	Q99219	290 aa		10.16	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	CKI1	P20485	582 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	YEL025C	P39991	1188 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	HXT8	P40886	569 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TAD1	P53065	400 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TAM41	P53230	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	ESBP6	P53918	673 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	NGL3	Q03210	505 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	SLD5	Q03406	294 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	CST9	Q06032	482 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	DUS4	Q06063	367 aa		10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
TOA2	YKL058W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	SMC1	P32908	1225 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	XRS2	P33301	854 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	NIP100	P33420	868 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	TIM8	P57744	87 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	YMR321C	Q04898	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	COQ9	Q05779	260 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	MLH2	Q07980	695 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	CHS2	P14180	963 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	SPR3	P41901	512 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	VPS53	P47061	822 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TOA2	YKL058W	JIP4	Q03361	876 aa		10.13	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39 ms