RNA–Protein interactions for RNA: YGL219C

MDM34, Transcript of Mitochondrial component of the ERMES complex, yeast

Gene MDM34, Length 1,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM34	YGL219C	SWH1	P35845	1188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	ATG14	P38270	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	DAS1	P47005	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SRB7	P47822	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	YGR016W	P53209	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	GRC3	Q07845	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	STH1	P32597	1359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SEC15	P22224	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SWC3	P31376	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	KAE1	P36132	386 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	TOS1	P38288	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	ERC1	P38767	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	FMP10	P40098	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SHE4	P51534	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	HOL1	P53389	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	ALG12	P53730	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	RAD33	Q04231	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	YLH47	Q06493	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	RAD16	P31244	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
MDM34	YGL219C	THI12	P42883	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	THI5	P43534	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	DAK2	P43550	591 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	THI11	P47183	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SAM37	P50110	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	THI13	Q07748	340 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
MDM34	YGL219C	YIG1	Q08956	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MDM34	YGL219C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RAD3	P06839	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CIT2	P08679	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PMS1	P14242	873 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CLB1	P24868	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PTR2	P32901	601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SHC1	P39000	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MPH1	P40562	993 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PXA1	P41909	870 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CTH1	P47976	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SWA2	Q06677	668 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PPG1	P32838	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	GRX7	P38068	203 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SAF1	P38352	637 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	HSE1	P38753	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RRF1	P38771	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PEX18	P38855	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	CAJ1	P39101	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	FTR1	P40088	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	NDC80	P40460	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	MET18	P40469	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	APD1	P38281	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ALG2	P43636	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	SVF1	Q05515	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	NNT1	Q05874	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RRI2	Q12348	645 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	RAD50	P12753	1312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ACE2	P21192	770 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	ROX1	P25042	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	DAL80	P26343	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
MDM34	YGL219C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM34	YGL219C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.6 ms