RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	RPN12	P32496	274 aa		5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	PAH1	P32567	862 aa		5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	PSF2	P40359	213 aa		5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	PPN1	Q04119	674 aa		5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	SHS1	Q07657	551 aa		5.21	□□□□□ -1.57
DNF2	YDR093W	SRD1	P09007	221 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ESL1	P40456	1118 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YJR079W	P47126	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YNL260C	P53846	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KRE28	Q04431	385 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ARP7	Q12406	477 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YRF1-2	P40105	1681 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RAD1	P06777	1100 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	AEP2	P22136	580 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MSP1	P28737	362 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RTT105	P40063	208 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YML6	P51998	286 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PGA2	P53903	129 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	IRC4	Q03036	179 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ATG11	Q12527	1178 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	FCP1	Q03254	732 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	DPL1	Q05567	589 aa		5.21	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	EMP47	P43555	445 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GAD1	Q04792	585 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MAS1	P10507	462 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PRE8	P23639	250 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	LDH1	P38139	375 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TOS3	P43637	560 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	BRO1	P48582	844 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KIC1	P38692	1080 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KAP114	P53067	1004 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RSC3	Q06639	885 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MAK31	P23059	88 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	KRE2	P27809	442 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SEC65	P29478	273 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	TRM2	P33753	639 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YJL206C	P39529	758 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	THI20	Q08224	551 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	REC8	Q12188	680 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YLL054C	Q12244	843 aa		5.2	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	LAM5	P43560	674 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PMT3	P47190	753 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	INO1	P11986	533 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GAL11	P19659	1081 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SIR1	P21691	654 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PSO2	P30620	661 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CTM1	P38818	585 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	LIF1	P53150	421 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GIM3	P53900	129 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	INA17	Q02888	182 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	VPS5	Q92331	675 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RSR1	P13856	272 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SUL1	P38359	859 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	PEA2	P40091	420 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YMR010W	Q03687	405 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	ATG20	Q07528	640 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	AAD15	Q08361	143 aa		5.19	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	POM152	P39685	1337 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	GPB2	P39717	880 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	HXT13	P39924	564 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	EAF6	P47128	113 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	APL4	Q12028	832 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MED2	Q12124	431 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	WHI2	P12611	486 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	DBF4	P32325	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	MSR1	P38714	643 aa		5.18	□□□□□ -1.58
DNF2	YDR093W	YFR018C	P43599	363 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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