RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B YHL026CP38740 315 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ERV46P39727 415 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YPS6P40583 537 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MSH4P40965 878 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B PKH1Q03407 766 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GIS4Q04233 774 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YMR321CQ04898 105 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ALR1Q08269 859 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data1.08□□□□□ -2.24not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B PCL8Q08966 492 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YPR204WQ08995 1032 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B LAP2Q10740 671 aa1.08□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data1.08□□□□□ -2.24not detected
tF(GAA)BtF(GAA)B VMA1P17255 1071 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GPI10P30777 616 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B BUD2P33314 1104 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GCS1P35197 352 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B DBP7P36120 742 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SAP190P36123 1033 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CST26P38226 397 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MGS1P40151 587 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B LTP1P40347 161 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ESL1P40456 1118 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B NOP2P40991 618 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YFH7P43591 353 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SRC1Q03707 834 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS64Q03944 604 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B HPF1Q05164 967 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B HEL2Q05580 639 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MRI1Q06489 411 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B AOS1Q06624 347 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B TMS1Q12116 473 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CTF3Q12748 733 aa1.07□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MPH3P0CE00 602 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B PDA1P16387 420 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SPE2P21182 396 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B TKL1P23254 680 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ERG6P25087 383 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GAC1P28006 793 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B IMP2'P32351 346 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B LYP1P32487 611 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ISF1P32488 338 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B RPT3P33298 428 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR202WP38887 602 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B BAT1P38891 393 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B POL5P39985 1022 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CHS6P40955 746 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GTS1P40956 396 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GAT1P43574 510 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ENT3P47160 408 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GCV2P49095 1034 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B TUB4P53378 473 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B INN1P53901 409 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B HEF3P53978 1044 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SPP1Q03012 353 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B THI22Q06490 572 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CSC1Q06538 782 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CDA1Q06702 301 aa1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SAM1P10659 382 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SEC18P18759 758 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SIR1P21691 654 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD27P26793 382 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B OXP1P28273 1286 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MSS51P32335 436 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GRX4P32642 244 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SHP1P34223 423 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B CCL1P37366 393 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B REG2P38232 338 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B GDH3P39708 457 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B NUG1P40010 520 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B VNX1P42839 908 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ALR2P43553 858 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B FET5P43561 622 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B POL32P47110 350 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B BFA1P47113 574 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B HLJ1P48353 224 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B HSV2P50079 448 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B PSP2P50109 593 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B ALT2P52892 507 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B DSD1P53095 428 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR338CQ05497 695 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B DUS3Q06053 668 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YLR271WQ06152 274 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B FMP25Q08023 583 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B YLL058WQ12198 575 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B WTM2Q12206 467 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SAC3P46674 1301 aa1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B MAS1P10507 462 aa1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B RAD18P10862 487 aa1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B SNF3P10870 884 aa1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B PDE1P22434 369 aa1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B LDB16P25587 256 aa1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B PDC6P26263 563 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
tF(GAA)BtF(GAA)B KIP1P28742 1111 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 94.5 ms