RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W NCS6P53088 359 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W ERO1Q03103 563 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-GR1Q12085 440 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MCM5P29496 775 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MET4P32389 672 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YKU70P32807 602 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SLD2P34252 453 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W LRG1P35688 1017 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W GPT2P36148 743 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SEA4P38164 1038 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W REI1P38344 393 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MMM1P41800 426 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W CIT3P43635 486 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W ALT1P52893 592 aa3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W KAR2P16474 682 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YBP2P53169 641 aa2.99□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YPR117WQ06116 2489 aa2.99□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W CAF20P12962 161 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SMY2P32909 740 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W PEA2P40091 420 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MON1P53129 644 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W ESC8Q08119 714 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W WHI5Q12416 295 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W LPD1P09624 499 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NNK1P36003 928 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W YKL077WP36081 392 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NIT1P40447 199 aa2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NEM1P38757 446 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W DAK2P43550 591 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.97□□□□□ -1.93not detected
SSQ1YLR369W TAF1P46677 1066 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W SDH1Q00711 640 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W NSI1Q12457 570 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W AUS1Q08409 1394 aa2.97□□□□□ -1.93
SSQ1YLR369W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W VMA4P22203 233 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W MSM1P22438 575 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W WHI3P34761 661 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W MOT2P34909 587 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W YGR045CP53229 120 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W TIM50Q02776 476 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W YPL109CQ02981 657 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W NUP145P49687 1317 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W HKR1P41809 1802 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W TAF13P11747 167 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W RDH54P38086 958 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W YGR117CP53270 476 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ORC3P54790 616 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ULP1Q02724 621 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W RKM2Q03942 479 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W IRC3Q06683 689 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W BDF2Q07442 638 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W OXR1Q08952 273 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W GRX6Q12438 231 aa2.96□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W MSH3P25336 1018 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W NFS1P25374 497 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W POL12P38121 705 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W PNT1P38969 423 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ADI1Q03677 179 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W UTP5Q04177 643 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W DAL4Q04895 635 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W AVO1Q08236 1176 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W YVC1Q12324 675 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W CSR2Q12734 1121 aa2.95□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94 RIP-Chip
SSQ1YLR369W SEC23P15303 768 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W SER1P33330 395 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W YAR028WP39548 234 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W SLS1P42900 643 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W RSM26P47141 266 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ECL1P48235 211 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W GSC2P40989 1895 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W UGA4P32837 571 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W SQT1P35184 431 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W HSE1P38753 452 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W PEX28P38848 579 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W GIP4P39732 760 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W VPS4P52917 437 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W TRM44Q02648 567 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W UBP16Q02863 499 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W TOS4Q06266 489 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W DFG16Q99234 619 aa2.94□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W GAS1P22146 559 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W STV1P37296 890 aa2.93□□□□□ -1.94
SSQ1YLR369W APE3P37302 537 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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