RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	TIM10	P87108	93 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	ESC8	Q08119	714 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	APC5	Q08683	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	PLP2	Q12017	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	PGS1	P25578	521 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	PCL2	P25693	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	HXT13	P39924	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	YAP5	P40574	245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	PCL10	P53124	433 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	HXT17	P53631	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	HXT15	P54854	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IKS1	YJL057C	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CDC9	P04819	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RPC53	P25441	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	LYP1	P32487	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RER2	P35196	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SEC9	P40357	651 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	JEM1	P40358	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RGD2	P43556	714 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NUT1	P53114	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MON1	P53129	644 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SRD1	P09007	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RAD18	P10862	487 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RER1	P25560	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NUD1	P32336	851 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PAH1	P32567	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ORC2	P32833	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PSY4	P38193	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RAD55	P38953	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	IRC6	P43615	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MRPL19	P53875	158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HOT1	Q03213	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RNH1	Q04740	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	COB	P00163	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PHO81	P17442	1178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	VMA3	P25515	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MBP1	P39678	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YJL055W	P47044	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MDE1	P47095	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HDA2	Q06629	674 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	BI4	P03879	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
IKS1	YJL057C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SFL1	P20134	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	APN1	P22936	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	IME2	P32581	645 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	BIT2	P38346	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PAN5	P38787	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CTR9	P89105	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
IKS1	YJL057C	ENT1	Q12518	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SAC3	P46674	1301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RAD53	P22216	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GSY1	P23337	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	VAC17	P25591	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	DUR3	P33413	735 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NPR3	P38742	1146 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NTA1	P40354	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	AXL1	P40851	1208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SWA2	Q06677	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MST1	P07236	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	DAL7	P21826	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	IRE1	P32361	1115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YBR284W	P38150	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CKB2	P38930	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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