RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
LRP1	YHR081W	GEM1	P39722	662 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	HFM1	P51979	1187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	SNO2	P53823	222 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	PLB2	Q03674	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	XYL2	Q07993	356 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
LRP1	YHR081W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	NIT1	P40447	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	MTC3	P53077	123 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	RSM24	Q03976	319 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LRP1	YHR081W	THI80	P35202	319 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	NPP2	P39997	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SGD1	Q06132	899 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ATG13	Q06628	738 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YPL277C	Q08989	487 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	LAM1	P38851	1228 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	UBP5	P39944	805 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SHE9	Q04172	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	TOD6	P34219	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YBR184W	P38299	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	MDM38	Q08179	573 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GIC1	P38785	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	TAT2	P38967	592 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	MEF2	P39677	819 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	RRT14	P40470	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GCV2	P49095	1034 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ENV11	P53246	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	MRP8	P35719	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ERT1	P38140	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
LRP1	YHR081W	PFD1	P46988	109 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SPT20	P50875	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	RIM8	P53179	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	GCN5	Q03330	439 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	MSC2	Q03455	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SOD2	P00447	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	PBY1	P38254	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SFB2	P53953	876 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	SRT1	Q03175	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	DUS4	Q06063	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	OSW2	Q12202	724 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ENA1	P13587	1091 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	RAD4	P14736	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	NPP1	P25353	742 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	YAP1801	P38856	637 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	IRR1	P40541	1150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	TAF1	P46677	1066 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRP1	YHR081W	CDC6	P09119	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	PPH3	P32345	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	SRP101	P32916	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	AFR1	P33304	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	FLR1	P38124	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	UBX5	Q06682	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	FMP25	Q08023	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	EMC1	P25574	760 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	YBR284W	P38150	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	ALR2	P43553	858 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	GPB1	Q08886	897 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	FUN30	P31380	1131 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	YRO2	P38079	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	MND2	P40577	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	TIM54	P47045	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	YAP6	Q03935	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	TPO1	Q07824	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	ESC8	Q08119	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	CDC20	P26309	610 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	CCC2	P38995	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	CDA1	Q06702	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRP1	YHR081W	HMI1	Q12039	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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