RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W MCR1P36060 302 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W PSY4P38193 441 aa9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W VTC2P43585 828 aa9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CBK1P53894 756 aa9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MIP1P15801 1254 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MCD4P36051 919 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W BSD2P38356 321 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ETP1P38748 585 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W GPB2P39717 880 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MID1P41821 548 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W RBA50Q04418 439 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W AFT2Q08957 416 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W SMC6Q12749 1114 aa9.9□□□□□ -0.82
DDI1YER143W VMA2P16140 517 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ESS1P22696 170 aa9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SAC6P32599 642 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W NOC2P39744 710 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W GPD2P41911 440 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W WAR1Q03631 944 aa9.89□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PKC1P24583 1151 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W MCM2P29469 868 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W EUG1P32474 517 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YKR018CP36114 725 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W BCD1P38772 366 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ARH1P48360 493 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YGR125WP53273 1036 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W LSC2P53312 427 aa9.88□□□□□ -0.83
DDI1YER143W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ASH1P34233 588 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W MOT2P34909 587 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W APE3P37302 537 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ADE17P38009 592 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W NUP82P40368 713 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YGR237CP50089 785 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W DIP5P53388 608 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PGA2P53903 129 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YDR344CQ05510 147 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W TMA16Q08687 178 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ERP3Q12403 225 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W RKM4Q12504 494 aa9.87□□□□□ -0.83
DDI1YER143W TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SES1P07284 462 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SUV3P32580 737 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W BCK2P33306 851 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PGM1P33401 570 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SIP3P38717 1229 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PIH1P38768 344 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W AIP1P46680 615 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PHM6Q05637 104 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YLH47Q06493 454 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YPR148CQ06523 435 aa9.86□□□□□ -0.83
DDI1YER143W CDC19P00549 500 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PGK1P00560 416 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SUP45P12385 437 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W TKL1P23254 680 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W MIC60P36112 540 aa9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W DBP7P36120 742 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W GUP1P53154 560 aa9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W CNM67P53865 581 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W DUS4Q06063 367 aa9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YDL057WQ07379 328 aa9.85□□□□□ -0.83
DDI1YER143W CLB5P30283 435 aa9.84□□□□□ -0.83
DDI1YER143W PXL1P36166 706 aa9.84□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
DDI1YER143W YOL075CQ08234 1294 aa9.84□□□□□ -0.83
DDI1YER143W SRD1P09007 221 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W CLN3P13365 580 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W PFK1P16861 987 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W FIS1P40515 155 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W HUL4P40985 892 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SPR3P41901 512 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YAF9P53930 226 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YMR321CQ04898 105 aa9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W HCR1Q05775 265 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
DDI1YER143W PSO2P30620 661 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W PGM2P37012 569 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W REG2P38232 338 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W BIM1P40013 344 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TLG2Q08144 397 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TCO89Q08921 799 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YPL216WQ08964 1102 aa9.82□□□□□ -0.84
DDI1YER143W ECM29P38737 1868 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W MRC1P25588 1096 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YET1P35723 206 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W PPS1P38148 807 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W ARK1P53974 638 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SLD5Q03406 294 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W CRD1Q07560 283 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TY3A-GQ12173 290 aa9.81□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TY3A-IQ99219 290 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72 ms