RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SQT1	P35184	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	JIP4	Q03361	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PEX29	Q03370	554 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	DUR3	P33413	735 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
SYF1	YDR416W	SAS3	P34218	831 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YEL1	P34225	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	IML2	P47031	731 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	RSM26	P47141	266 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SGM1	P47166	707 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	NPY1	P53164	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MSM1	P22438	575 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PCL2	P25693	308 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	BRF1	P29056	596 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PEX28	P38848	579 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	VPS8	P39702	1274 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SAP155	P43612	1002 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YJR096W	P47137	282 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	ENT3	P47160	408 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	GPI8	P49018	411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PSR1	Q07800	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MSS18	P08593	268 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SRD1	P09007	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YGR016W	P53209	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YNR063W	P53749	607 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	CTF4	Q01454	927 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PML39	Q03760	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PHM6	Q05637	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	INO1	P11986	533 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	RAD53	P22216	821 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	FBP26	P32604	452 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	XDJ1	P39102	459 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MBP1	P39678	833 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	QDR2	P40474	542 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MEP3	P53390	489 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	CDC9	P04819	755 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	YBR287W	P38355	427 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	CKB2	P38930	258 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	CAJ1	P39101	391 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	ERO1	Q03103	563 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PKH1	Q03407	766 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PSH1	Q12161	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	BEM3	P32873	1128 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	BCD1	P38772	366 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	MEP1	P40260	492 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	CAF120	P53836	1060 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	PMT7	Q06644	662 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	RKM4	Q12504	494 aa		4.71	□□□□□ -1.65
SYF1	YDR416W	SFL1	P20134	766 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	DOM34	P33309	386 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RRN7	P40992	514 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	WTM2	Q12206	467 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	ERR3	P42222	437 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	QRI7	P43122	407 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	APP1	P53933	587 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	GTR1	Q00582	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	VPS15	P22219	1454 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RAD18	P10862	487 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PHO81	P17442	1178 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	PAN5	P38787	379 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	RMP1	Q12530	201 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYF1	YDR416W	MOD5	P07884	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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