RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Exoc6bA6H5Z3 810 aa36.13■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rlbp1Q9Z275 317 aa36.13■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttll7A4Q9F0 912 aa36.12■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tm6sf1P58749 370 aa36.12■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prr29B1ARI9 187 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prkar2bP31324 416 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbln2P37889 1221 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igfbp6P47880 238 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Syde2E9PUP1 1314 aa36.11■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa36.1■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppm1mQ8BU27 406 aa36.1■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa36.09■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ly75Q60767 1723 aa36.09■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgap33Q80YF9 1305 aa36.08■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atl3Q91YH5 541 aa36.08■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa36.07■■■■□ 3.37
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx58Q6Q899 926 aa36.06■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zap70P43404 618 aa36.05■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mum1Q6DID5 682 aa36.03■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Triml2E9PW10 424 aa36.02■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wwc1Q5SXA9 1104 aa36.02■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Supt16hQ920B9 1047 aa36.02■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MypnQ5DTJ9 1315 aa36.01■■■■□ 3.36
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GalcP54818 684 aa36■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col4a1P02463 1669 aa35.99■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clcn1Q64347 994 aa35.98■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AbraQ8BUZ1 375 aa35.97■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb1Q91VL9 713 aa35.97■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cluap1Q8R3P7 413 aa35.96■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx60E9PZQ1 1711 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Grm8P47743 908 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chmp5Q9D7S9 219 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa35.95■■■■□ 3.35
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Miga2Q8BK03 593 aa35.94■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bicdl1A0JNT9 577 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AU019823E9PUQ3 292 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fkbp5Q64378 456 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam13aQ8BGI4 693 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim27Q62158 513 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa35.93■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp8b2P98199 1209 aa35.92■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa35.91■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc4a3P16283 1227 aa35.91■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smarcc1P97496 1104 aa35.91■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SkilQ60665 675 aa35.91■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ripor2Q80U16 1078 aa35.9■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tceal9Q9DD24 104 aa35.9■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ehd4Q9EQP2 541 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EspnQ9ET47 871 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AK157302I3ITR1 129 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map3k13Q1HKZ5 959 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sugp2Q8CH09 1067 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Isca1Q9D924 129 aa35.89■■■■□ 3.34
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hspa2P17156 633 aa35.88■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Armcx1Q9CX83 456 aa35.87■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stard3nlQ9DCI3 235 aa35.87■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prr5lA2AVJ5 370 aa35.86■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc43Q3V0L5 667 aa35.86■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srgap3Q812A2 1099 aa35.85■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cwc25Q9DBF7 416 aa35.85■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa35.85■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vars2Q3U2A8 1060 aa35.84■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Soga3Q6NZL0 945 aa35.84■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrc1Q61830 1456 aa35.83■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Anp32aO35381 247 aa35.83■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LifrP42703 1092 aa35.83■■■■□ 3.33
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ier5O89113 308 aa35.82■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myd88P22366 296 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm13023A2A8N2 498 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cwc27Q3TKY6 469 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cgnl1Q6AW69 1298 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cetn4Q8K4K1 168 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa35.81■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Esco1Q69Z69 843 aa35.79■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd13dQ6PD24 605 aa35.79■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aldh8a1Q8BH00 487 aa35.79■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nphp1Q9QY53 687 aa35.79■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssc5dQ8BV57 1371 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tlr7P58681 1050 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gnat3Q3V3I2 354 aa35.78■■■■□ 3.32
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubap1lG3UW59 384 aa35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 71.5 ms