RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Btbd11Q6GQW0 1109 aa26,74■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 KinQ8K339 391 aa26,74■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Echdc1Q9D9V3 322 aa26,74■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tgfb1i1Q62219 461 aa26,73■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adcy9P51830 1353 aa26,73■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cct4P80315 539 aaKnown RBP26,73■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc7Q9D541 371 aa26,73■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc10Q9DC23 793 aa26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EspnlQ3UYR4 1005 aa26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddrgk1Q80WW9 315 aa26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atg3Q9CPX6 314 aa26,72■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brf1Q8CFK2 676 aa26,71■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rad50P70388 1312 aa26,71■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP26,7■■□□□ 1,87
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gripap1Q8VD04 806 aa26,7■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nfat5Q9WV30 1534 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif4P33174 1231 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col1a2Q01149 1372 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm6aO70546 1401 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb45Q52KG4 520 aa26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP26,69■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k2Q61083 619 aa26,68■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Robo1O89026 1612 aa26,68■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gjb2Q00977 226 aa26,68■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pof1bQ8K4L4 587 aa26,68■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alpk3Q924C5 1678 aa26,68■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Strn4P58404 760 aa26,67■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncoa4Q5U4H9 625 aa26,67■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 E4f1Q8CCE9 783 aa26,67■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP26,66■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tceal9Q9DD24 104 aa26,66■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Aox2Q5SGK3 1345 aa26,66■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa26,66■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem2Q5FWI3 1383 aa26,65■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc12Q80WJ6 1366 aa26,65■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rufy3Q9D394 469 aa26,65■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam228bQ497Q6 232 aa26,65■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP26,65■■□□□ 1,86
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hoxa7P02830 229 aa26,64■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 F2rP30558 430 aa26,64■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rcan3Q9JKK0 239 aa26,64■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nid2O88322 1403 aa26,63■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Brpf1B2RRD7 1212 aa26,63■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zscan25B2RX31 543 aa26,63■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MyclP10166 368 aa26,63■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc155Q80VJ8 648 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm4aQ8BW72 1064 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gimap6Q8K349 305 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GckrQ91X44 587 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TimelessQ9R1X4 1197 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pank2Q3U4S0 443 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Taf5lQ91WQ5 589 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa26,62■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BcorQ8CGN4 1759 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Top1mtQ8R4U6 593 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Add2Q9QYB8 725 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sytl4Q9R0Q1 673 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp10bB1AWN4 1474 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naa30Q8CES0 364 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fez1Q8K0X8 392 aa26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP26,61■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnh5Q920E3 988 aa26,6■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP26,6■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmnl2A2APV2 1086 aa26,59■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa26,59■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb3Q91X45 518 aa26,59■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col14a1Q80X19 1797 aa26,59■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc4E9Q236 1325 aa26,58■■□□□ 1,85
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PsapQ61207 557 aaKnown RBP26,58■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ifit2Q64112 472 aa26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tti2Q8BGV4 512 aa26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Flt4P35917 1363 aa26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DpydQ8CHR6 1025 aa26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chd1lQ9CXF7 900 aa26,57■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ets1P27577 440 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syt1P46096 421 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EappQ5BU09 281 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SympkQ80X82 1284 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irf9Q61179 399 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdca7lQ922M5 438 aa26,56■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igfbp6P47880 238 aa26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stx6Q9JKK1 255 aa26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr17E9Q271 1322 aa26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Erbb4Q61527 1308 aa26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clcn1Q64347 994 aa26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP26,55■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10471E9Q1C7 252 aa26,54■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tns3Q5SSZ5 1440 aa26,54■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa26,54■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Babam1Q3UI43 333 aa26,54■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem119Q8R138 280 aa26,53■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa26,53■■□□□ 1,84
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ush1cQ9ES64 910 aa26,53■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40,4 ms