RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W DUR3P33413 735 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W PGM2P37012 569 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ASG1P40467 964 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W UBP14P38237 781 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W BOI2P39969 1040 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ALR2P43553 858 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY2B-BQ12491 1770 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ADY4Q05955 493 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TTI1P36097 1038 aa3.42□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.42□□□□□ -1.86not detected
SIN3YOL004W HOP09932 586 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MGE1P38523 228 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YDR344CQ05510 147 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W KTR2P33550 425 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SPC42P36094 363 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W ADP1P25371 1049 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W NEM1P38757 446 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YJR008WP47085 338 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W TY1B-BLQ12490 1755 aa3.41□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W HIS5P07172 385 aa3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W MSH2P25847 964 aa3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W HMF1P40037 129 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W YNL134CP53912 376 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W HIF1Q12373 385 aa3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data3.4□□□□□ -1.86not detected
SIN3YOL004W TFB1P32776 642 aa3.4□□□□□ -1.86
SIN3YOL004W SEC62P21825 274 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PAP2P53632 584 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YPL066WQ12194 479 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W HIP1P06775 603 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W URK1P27515 501 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TFC4P33339 1025 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RIM4P38741 713 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W FAR11P53917 953 aa3.4□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ESL1P40456 1118 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ENT3P47160 408 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SFB2P53953 876 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W BNA5Q05979 453 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GUT1P32190 709 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W AIM23P47015 356 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W NPA3P47122 385 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W STP1Q00947 519 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ENT2Q05785 613 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RAV1P47104 1357 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W AI3P03877 415 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MLS1P30952 554 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MAF1P41910 395 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YPP1P46951 817 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W LSB1P53281 241 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PMS1P14242 873 aa3.39□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PIF1P07271 859 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W APM2P38700 605 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MSC2Q03455 724 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YDR018CQ12185 396 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RTC1Q08281 1341 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPL43BP0CX26 92 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TOM20P35180 183 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MAD1P40957 749 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YLR456WQ06199 204 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MNR2P35724 969 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MSS4P38994 779 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YNL034WP53963 612 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W YNL018CP53976 612 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W NUP192P47054 1683 aa3.38□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W COX3P00420 269 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W OCA5P38738 679 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SUM1P46676 1062 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W TMN2Q04562 672 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W POB3Q04636 552 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W PET10P36139 283 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W RRI2Q12348 645 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SPO24Q3E752 67 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W FLO11P08640 1367 aa3.37□□□□□ -1.87
SIN3YOL004W SUV3P32580 737 aa3.37□□□□□ -1.87
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