RNA–Protein interactions for RNA: YMR033W

ARP9, Transcript of Component of both the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes, yeast

Gene ARP9, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP9	YMR033W	FMP25	Q08023	583 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	GNT1	Q12096	491 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YPL066W	Q12194	479 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	SPO21	Q12411	609 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	CIT2	P08679	460 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5	□□□□□ -1.61	not detected
ARP9	YMR033W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	MBP1	P39678	833 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YGR125W	P53273	1036 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RNH70	P53331	553 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YMR187C	Q03236	431 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	FLC1	Q08967	793 aa		5	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	BUD6	P41697	788 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	ALT1	P52893	592 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PHM7	Q12252	991 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YER152C	P10356	443 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	ARE1	P25628	610 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PPG1	P32838	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	TAT1	P38085	619 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	GPB2	P39717	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	ERP6	P53198	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	TPP1	Q03796	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	EAF1	Q06337	982 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	CIT1	P00890	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	PFD1	P46988	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YJL045W	P47052	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	GAL11	P19659	1081 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	AKR1	P39010	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	ALR2	P43553	858 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARP9	YMR033W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	PNT1	P38969	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	HUL4	P40985	892 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	MMM1	P41800	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	TNA1	P53322	534 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	EAR1	Q03212	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	PPM2	Q08282	695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	SCT1	P32784	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YSC84	P32793	468 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	BRN1	P38170	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	NUP82	P40368	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
ARP9	YMR033W	UBX5	Q06682	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	COQ2	P32378	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	SKN7	P38889	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	GEM1	P39722	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	MXR1	P40029	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	CIT3	P43635	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	TPO2	P53283	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	ALG12	P53730	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
ARP9	YMR033W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	COQ4	O13525	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	CAN1	P04817	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	TIM23	P32897	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	SAF1	P38352	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	RCM1	P53972	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YVC1	Q12324	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	PHO8	P11491	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	CDC11	P32458	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YHL012W	P38709	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	CCC2	P38995	1004 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
ARP9	YMR033W	DOS2	P54858	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	TAF8	Q03750	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	ACM1	Q08981	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	YLR125W	Q12138	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ARP9	YMR033W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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