RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A MKK2P32491 506 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A LAM1P38851 1228 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A MEF2P39677 819 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SPT20P50875 604 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YOR352WQ08816 343 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A MCD1Q12158 566 aa4.81□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A CYC8P14922 966 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A PIK1P39104 1066 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A PLB2Q03674 706 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YDR132CQ03900 495 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YPL260WQ08977 551 aa4.8□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YLR358CO13565 187 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data4.79□□□□□ -1.64not detected
YMR001C-AYMR001C-A PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.79□□□□□ -1.64not detected
YMR001C-AYMR001C-A SEC8P32855 1065 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SHM2P37291 469 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A HXT13P39924 564 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A HXT17P53631 564 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SIW14P53965 281 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A HXT15P54854 567 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A MRL1Q06815 381 aa4.79□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A GCR1P07261 785 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A YER152CP10356 443 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A MLS1P30952 554 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A GNP1P48813 663 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A GCN5Q03330 439 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A SPR28Q04921 423 aa4.78□□□□□ -1.64
YMR001C-AYMR001C-A TAF13P11747 167 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A CMP2P14747 604 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A ATE1P16639 503 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A SRM1P21827 482 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A CTS1P29029 562 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A POL32P47110 350 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A ENV11P53246 860 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A TAD3Q9URQ3 322 aa4.77□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A GAL10P04397 699 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A SYP1P25623 870 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A SLD2P34252 453 aa4.76□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65not detected
YMR001C-AYMR001C-A RFC5P38251 354 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A TAT2P38967 592 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
YMR001C-AYMR001C-A FYV10P40492 516 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A HNT2P49775 206 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A RSM24Q03976 319 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A DUS4Q06063 367 aa4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A RIB2Q12362 591 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A RGD1P38339 666 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A MGE1P38523 228 aa4.74□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.74□□□□□ -1.65not detected
YMR001C-AYMR001C-A CNN1P43618 361 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A SVS1Q12254 260 aa4.73□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A DBP5P20449 482 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A RER2P35196 286 aa4.72□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A MXR1P40029 184 aa4.72□□□□□ -1.65
YMR001C-AYMR001C-A TUB2P02557 457 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A APL1P27351 700 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A PEP7P32609 515 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A MPH1P40562 993 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A YJR107WP47145 328 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A ENT3P47160 408 aa4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A BAS1P22035 811 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A CDC20P26309 610 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A MCM7P38132 845 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A GCV2P49095 1034 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A TIF35Q04067 274 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A GPB1Q08886 897 aa4.7□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A CDC6P09119 513 aa4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A DBP2P24783 546 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A GSF2Q04697 403 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A TMA10Q06177 86 aa4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RXT3Q07458 294 aa4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A LST4P34239 828 aa4.68□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A UGA2P38067 497 aa4.68□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RAD27P26793 382 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A DOM34P33309 386 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A YPT53P36019 220 aa4.67□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A BI4P03879 638 aa4.66□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A YML020WQ03722 664 aa4.66□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A YAP6Q03935 383 aa4.66□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A RTT10Q08924 1013 aa4.66□□□□□ -1.66
YMR001C-AYMR001C-A ACE2P21192 770 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A EMC1P25574 760 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A MSC2Q03455 724 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A ATG13Q06628 738 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A GNT1Q12096 491 aa4.65□□□□□ -1.67
YMR001C-AYMR001C-A PNS1Q12412 539 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.5 ms