RNA–Protein interactions for RNA: YJR001W

AVT1, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT1, Length 1,809 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT1	YJR001W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CAJ1	P39101	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SAP185	P40856	1058 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	PUS6	P53294	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RPB10	P22139	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MCM10	P32354	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NUP120	P35729	1037 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YKL050C	P35736	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SLI15	P38283	698 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YBR197C	P38306	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MRPS18	P42847	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	STR2	P47164	639 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MAL11	P53048	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	VTI1	Q04338	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ERV41	Q04651	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	DBF20	P32328	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	KTR2	P33550	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	KDX1	P36005	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RTA1	P53047	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TUB4	P53378	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CTR9	P89105	1077 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	BDS1	Q08347	646 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SSP2	Q08646	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TFB4	Q12004	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MCD1	Q12158	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SRB8	P25648	1427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	AAD3	P25612	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TFC4	P33339	1025 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	OPY1	P38271	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RGA1	P39083	1007 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YJR115W	P47152	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ERO1	Q03103	563 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TAF8	Q03750	510 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	FMP25	Q08023	583 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	APC2	Q12440	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MEF1	P25039	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RSC4	Q02206	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SDH5	Q08230	162 aa		4.92	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
AVT1	YJR001W	BUD3	P25558	1636 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	BAS1	P22035	811 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CHS3	P29465	1165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	GUT2	P32191	649 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YHL041W	P38730	149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	PFD1	P46988	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TRE2	Q08693	809 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	UGA3	P26370	528 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ISC10	P32645	267 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	NPL4	P33755	580 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	BET3	P36149	193 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	RIM4	P38741	713 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TMA108	P40462	946 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SGM1	P47166	707 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	BTN2	P53286	410 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	JJJ1	P53863	590 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	EEB1	Q02891	456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
AVT1	YJR001W	SWI6	P09959	803 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	TEC1	P18412	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	NIP100	P33420	868 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	NIC96	P34077	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	ESL2	P36168	1195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	VPS8	P39702	1274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	GEM1	P39722	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	FIG4	P42837	879 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	SMC3	P47037	1230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AVT1	YJR001W	ERP6	P53198	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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