RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W MGE1P38523 228 aa4.97□□□□□ -1.61
SNX4YJL036W DAK2P43550 591 aa4.97□□□□□ -1.61
SNX4YJL036W HNT2P49775 206 aa4.97□□□□□ -1.61
SNX4YJL036W EST2Q06163 884 aa4.97□□□□□ -1.61
SNX4YJL036W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W MET4P32389 672 aa4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W YPL109CQ02981 657 aa4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SVF1Q05515 481 aa4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W PUS9Q12069 462 aa4.96□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W HEM13P11353 328 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SEC23P15303 768 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W KIP1P28742 1111 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SEC8P32855 1065 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W TRM2P33753 639 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W BAP2P38084 609 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SEC26P41810 973 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W DUS4Q06063 367 aa4.95□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data4.94□□□□□ -1.62not detected
SNX4YJL036W AFG2P32794 780 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W DOM34P33309 386 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W TNA1P53322 534 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W PLB2Q03674 706 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W ROT1Q03691 256 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W IOC4Q04213 475 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W RSB1Q08417 382 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W PTC5Q12511 572 aa4.94□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W TAF13P11747 167 aa4.93□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W TOS4Q06266 489 aa4.93□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W PIK1P39104 1066 aa4.92□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W GPB2P39717 880 aa4.92□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W RPN3P40016 523 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W MSE1P48525 536 aa4.92□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SLI1P53304 468 aa4.92□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W HXK1P04806 485 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W OCA5P38738 679 aa4.91□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W NNF1P47149 201 aa4.91□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W YPL260WQ08977 551 aa4.91□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SPO21Q12411 609 aa4.91□□□□□ -1.62
SNX4YJL036W SNF5P18480 905 aa4.9□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W YPT53P36019 220 aa4.9□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W ALG3P38179 458 aa4.9□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W FAA3P39002 694 aa4.9□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W YJR107WP47145 328 aa4.9□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W HCM1P25364 564 aa4.89□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W CDC20P26309 610 aa4.89□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W PIC2P40035 300 aa4.89□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W GAL10P04397 699 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W DED1P06634 604 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W SRM1P21827 482 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W STE11P23561 717 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W RPT1P33299 467 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W LST4P34239 828 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W SUN4P53616 420 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W RSM24Q03976 319 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W TMA10Q06177 86 aa4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W BRN1P38170 754 aa4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W FYV10P40492 516 aa4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MNN10P50108 393 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W RXT3Q07458 294 aa4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MCD1Q12158 566 aa4.87□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W CDC6P09119 513 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W CMP2P14747 604 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W RFC5P38251 354 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MRPS18P42847 217 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W ENT3P47160 408 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W GPB1Q08886 897 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W NTO1Q12311 748 aa4.86□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W YGR122WP53272 402 aa4.85□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W PRE9P23638 258 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MCM2P29469 868 aa4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W PMI40P29952 429 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MAD1P40957 749 aa4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W PBP1P53297 722 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W SIW14P53965 281 aa4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W SPR28Q04921 423 aa4.84□□□□□ -1.63
SNX4YJL036W MKK2P32491 506 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W PEP7P32609 515 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RGD1P38339 666 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W AIM21P40563 679 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W CTF4Q01454 927 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W ROD1Q02805 837 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W YOL098CQ12496 1037 aa4.83□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W CLN2P20438 545 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W CHS7P38843 316 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W VAC8P39968 578 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W YFL054CP43549 646 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W PHO23P50947 330 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W VPS62P53285 467 aa4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W ALD6P54115 500 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W SPC42P36094 363 aa4.81□□□□□ -1.64
SNX4YJL036W URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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