RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	SEC15	P22224	910 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BUD2	P33314	1104 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	FYV10	P40492	516 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	COG6	P53959	839 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	OCA6	Q12454	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SIP3	P38717	1229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SAK1	P38990	1142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	DOT5	P40553	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PXA1	P41909	870 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MDJ2	P42834	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YJL181W	P46987	611 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RPA14	P50106	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ERP6	P53198	216 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ADA2	Q02336	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	LAM6	Q08001	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TFB4	Q12004	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PPH3	P32345	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ATO2	P32907	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PPX1	P38698	397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YER130C	P39959	443 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VTC2	P43585	828 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	STR2	P47164	639 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SGM1	P47166	707 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VPS75	P53853	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YNL144C	P53907	740 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	FAR11	P53917	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GTR1	Q00582	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RSM28	Q03430	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TRS120	Q04183	1289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YLH47	Q06493	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SLM3	Q12093	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	WSC3	Q12215	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	VAN1	P23642	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GSY2	P27472	705 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RPC34	P32910	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NPL4	P33755	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	COY1	P34237	679 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PTC4	P38089	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	REV7	P38927	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ATG3	P40344	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SAP185	P40856	1058 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SPC24	Q04477	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YIG1	Q08956	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GPR1	Q12361	961 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HMG1	P12683	1054 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ITR2	P30606	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SDS3	P40505	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SPO1	P53541	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ALF1	P53904	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	UFD2	P54860	961 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MSH5	Q12175	901 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YPR089W	O13585	888 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	MRP8	P35719	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YBR242W	P38331	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BUD16	P39988	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	YEL023C	P39992	682 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	ECL1	P48235	211 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	PCL10	P53124	433 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	CIK1	Q01649	594 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BDF2	Q07442	638 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	TMA16	Q08687	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	GNT1	Q12096	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	REP1	P03871	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	HIS3	P06633	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKG6	YHR149C	SEN2	P16658	377 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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