Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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ARL2-SNX15V9GYD0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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