Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC01558Q9Y6Z2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms