Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00312Q9Y6C7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms