Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC3Q9UQE7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMC3Q9UQE7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms