Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HPS5Q9UPZ3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms