Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USP18Q9UMW8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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USP18Q9UMW8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USP18Q9UMW8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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