Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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TPCN1Q9ULQ1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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TPCN1Q9ULQ1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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TPCN1Q9ULQ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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TPCN1Q9ULQ1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPCN1Q9ULQ1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPCN1Q9ULQ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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