Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEFF2Q9UIK5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms