Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIP2Q9UDT6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms