Protein–RNA interactions for Protein: Q9P000

COMMD9, COMM domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD9Q9P000 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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COMMD9Q9P000 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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COMMD9Q9P000 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD9Q9P000 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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