Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms