Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVK13-1Q9NX77 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms