Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms