Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG3Q9NT62 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms