Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SAMSN1Q9NSI8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SAMSN1Q9NSI8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms