Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FBXO8Q9NRD0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FBXO8Q9NRD0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms