Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHST12Q9NRB3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CHST12Q9NRB3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms