Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE41Q9C0J9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms