Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4CQ9C0C4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SEMA4CQ9C0C4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms