Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM3Q9BZL3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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