Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BARHL1Q9BZE3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BARHL1Q9BZE3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms