Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUS3Q9BZE2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms