Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RTFDC1Q9BY42 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms