Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF17Q9BXT8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RNF17Q9BXT8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms