Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRIP1Q9BX63 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRIP1Q9BX63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms